L’Organismo tradizionalmente si è articolato in due Sezioni una per la regolazione, il controllo e la vigilanza in materia economica e finanziaria, l’altra per la regolazione, il controllo e la vigilanza in materia amministrativa.
La nuova Costituzione apostolica ha istituito, presso la stessa Segreteria per l’Economia, la Direzione per le Risorse Umane della Santa Sede la quale provvede, in dialogo e cooperazione con gli Enti interessati, a tutto quanto riguarda la posizione e gestione lavorativa del personale, ad autorizzare le assunzioni, verificandone i requisiti, e ad approvare le tabelle organiche.
